Сюжет «Кибердеревни» погружает зрителя в пространство, где цифровое и реальное переплетаются до неразличимости. Герой, программист по профессии, случайно оказывается в деревне, где действуют странные законы. Здесь техника ведёт себя непредсказуемо, люди напоминают элементы алгоритма, а бытовые мелочи начинают выполнять функции компьютерных программ. Сначала это кажется нелепым, но вскоре превращается в кошмар, из которого нет выхода.

Обстановка становится всё более жуткой: жители исчезают, а вместо привычных обрядов появляются странные ритуалы, в которых центральное место занимают технологии. Каждый новый шаг героя вызывает цепочку событий, которая словно прописана заранее. Постепенно он понимает, что оказался в сердце некоего кода, где его собственная жизнь зависит от чужих правил. Сериал оставляет открытые вопросы, заставляя зрителя вместе с героем искать разгадку.